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  • 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所(前身为中国农业科学院北京畜牧研究所,2006年更名)成立于1957年,隶属于农业农村部,是国家设立的中央级畜牧科研机构,是畜牧领域国家战略科技力量。
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  • 牧医所设有动物遗传资源与育种、动物生物技术与繁殖、动物营养与饲料、草业科学、动物医学和畜产品质量与安全6大学科,21个科技创新研究团队,其中入选科技部重点领域创新团队、中华农业科技奖优秀创新团队、全国专业技术人才先进集体等称号13项。
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  • 牧医所现有在职职工232人,其中中国工程院院士2人,正高级专业技术职称人员75人,博士生导师77人,国家级人才项目入选者34人,已形成专业结构合理、创新能力突出、具有国内外学术影响力的人才队伍。
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  • 牧医所现有6个科技创新平台、6个科技支撑平台、3个科技服务平台和1个大型仪器设备共享平台;拥有各类科研试验基地10个,其中,自有试验基地4个,共建科研基地6个。
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  • 高效率开放共享
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  • 在国家农业科技创新联盟框架下,牧医所先后牵头成立了 国家奶业科技创新联盟 、国家畜牧科技创新联盟、 国家鸽业科技创新联盟。
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  • 研究生教育坚持立德树人的根本任务,以服务党和国家战略需求和提高研究生创新能力为导向,加快构建世界一流的高水平人才培养体系,培养肩负使命、追求卓越的高层次创新人才,为建设社会主义现代化强国、实现中华民族伟大复兴作出更大贡献。
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国际首例猪T2T全基因组组装成功

来源:猪遗传育种创新团队 作者:刘欣 发布时间:2025-02-12

2月8日,中国农业科学院北京畜牧兽医研究所张龙超研究员、黑龙江省农业科学院畜牧研究所刘娣研究员、重庆市畜牧科学院王金勇研究员、岳麓山实验室印遇龙院士、四川农业大学李明洲教授联合发布消息,国际首个猪T2T全基因组组装——民猪完整全基因组构建成功完成,标志着猪基因组研究迈入“完整解析”时代,为我国养殖业提质增效及高质量发展提供重要科技支撑。

该成果由中国农业科学院北京畜牧兽医研究所猪遗传育种创新团队张龙超研究员牵头,联合黑龙江省农业科学院畜牧研究所刘娣研究员团队、重庆市畜牧科学院王金勇研究员团队、岳麓山实验室印遇龙院士团队、四川农业大学李明洲教授团队等科研团队共同攻关,以中国北方代表性地方猪种——民猪为对象,基于多项前沿技术,完成了民猪完整基因组构成,填补了猪T2T基因组组装领域国际空白,为猪遗传育种和功能基因挖掘提供高精度“蓝图”,成果达到国际领先水平。

团队成功组装了基因组大小为2.66Gb的完整基因组,首次完整解析了民猪所有染色体着丝粒和端粒结构,发现1-12号染色体及X染色体为中间着丝粒,而13-18号染色体为端着丝粒,为揭示染色体进化机制提供关键数据。

团队基于T2T框架构建高质量的民猪泛基因组,鉴定出194234个高置信结构变异(SV),系统解析了SV的分布特征与功能关联。这一成果将猪基因组结构变异解析能力提升至新高度,为精准挖掘重要性状相关基因奠定技术基础。

团队还依托T2T基因组数据新发现89个与冷适应相关的候选基因,其中TPT1基因被确认为关键调控因子。通过整合SV与RNA测序分析,进一步锁定17个与结构变异直接关联的冷适应基因。这些发现为培育耐寒猪种、应对极端气候提供重要靶点。

团队利用泛基因组结构变异数据,评估了基因组选择(GS)技术对猪体型性状选种效果。结果显示,选种准确性达70%-88%。大部分性状同时利用单碱基和结构变异选种准确性较传统方法提升2%-4%。此外,团队通过精细定位发现调控猪体型的关键基因CL3及其核心结构变异位点,为种猪高效精准选育提供新策略。

据介绍,该成果在应用层面展现出多重优势,在基因组完整性方面为猪遗传多样性研究、进化分析及疾病抗性基因挖掘提供完整参考;该成果显著提升基因组选择效率,加速优良性状定向改良,实现精准育种;冷适应基因的发现为环境适应性育种开辟新路径。

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图  以民猪完成国际首例猪T2T全基因组组装

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图  我国北方代表性地方猪种——民猪

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