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  • 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所(前身为中国农业科学院畜牧研究所,2006年更名)成立于1957年,隶属于农业农村部,是国家设立的中央级畜牧科研机构,是畜牧领域国家战略科技力量。
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  • 牧医所设有动物遗传资源与育种、动物生物技术与繁殖、动物营养与饲料、草业科学、动物医学和畜产品质量与安全6大学科,21个科技创新研究团队,其中入选科技部重点领域创新团队、中华农业科技奖优秀创新团队、全国专业技术人才先进集体等称号13项。
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  • 牧医所现有在职职工232人,其中中国工程院院士2人,正高级专业技术职称人员75人,博士生导师77人,国家级人才项目入选者34人,已形成专业结构合理、创新能力突出、具有国内外学术影响力的人才队伍。
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  • 牧医所现有6个科技创新平台、6个科技支撑平台、3个科技服务平台和1个大型仪器设备共享平台;拥有各类科研试验基地10个,其中,自有试验基地4个,共建科研基地6个。
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  • 高效率开放共享
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  • 在国家农业科技创新联盟框架下,牧医所先后牵头成立了 国家奶业科技创新联盟 、国家畜牧科技创新联盟、 国家鸽业科技创新联盟。
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  • 研究生教育坚持立德树人的根本任务,以服务党和国家战略需求和提高研究生创新能力为导向,加快构建世界一流的高水平人才培养体系,培养肩负使命、追求卓越的高层次创新人才,为建设社会主义现代化强国、实现中华民族伟大复兴作出更大贡献。
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鸡基因组调控图谱ChickenGTEx平台上线

来源:国家畜禽种质资源库 作者:侯娅丽 发布时间:2025-09-06

8月19日,中国农业科学院北京畜牧兽医研究所(智能计算平台)联合中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)、美国加利福尼亚大学戴维斯分校、丹麦奥胡斯大学、中国农业大学等完成的鸡遗传变异-分子表型-表型关联信息知识平台ChickenGTEx(http://chicken.farmgtex.org)正式发布。该平台涵盖鸡跨组织、跨性别等多维度遗传变异调控图谱,包含了遗传变异、泛转录本分子表型及表型间的调控关系及调控效应,为鸡重要经济性状遗传机制解析、精准育种及人工智能表型预测提供了重要数据信息资源平台,服务农业科技基础研究和育种创新攻关。相关内容发表在《核酸研究(Nucleic Acids Research)》期刊。

聚焦畜禽重要经济性状机制解析缺乏足够的精度和深度及可利用资源短缺这一难题,ChickenGTEx平台汇聚了:1)全球123个品种2869只鸡的全基因组遗传变异;2)28个组织鉴定的5种分子表型(基因表达、可变剪接、可变多聚腺苷酸化(APA)等);3)257个表观基因组图谱及基于此预测的染色质状态和调控元件;4)9个组织191个细胞类型的单细胞基因表达谱;5)百万级关联分子表型的遗传变异与调控效应;6)不同性别、组织、细胞类型的特异性调控效应;7)96386个关联鸡108个重要表型的遗传变异及潜在分子机制。


中国农业科学院北京畜牧兽医研究所(智能计算平台)于2025年1月投入运行,旨在赋能农业动物大数据及人工智能等领域研究,推动农业动物产业向信息化、智能化升级,实现资源信息化共享。牧医所侯娅丽研究员、中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)章张研究员、奥胡斯大学房灵昭副教授为本文共同通讯作者,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)邹东高级工程师、北京市农林科学院初芹研究员、河南中医药大学王瑞珍博士后、UC Davis大学管代禄博士后等为共同第一作者。数据库展示的相关分析和结果解读主要来源于参与文章“Genetic regulation of gene expression across multiple tissues in chickens”,于2025年4月发表在《自然·遗传学(Nature Genetics)》上。研究获国家重点研发计划等项目支持。

原文链接:

《Nucleic Acids Research》: https://doi.org/10.1093/nar/gkaf731

《Nature Genetics》: https://www.nature.com/articles/s41588-025-02155-9

数据库地址:http://chicken.farmgtex.org

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