我所畜禽资源收集、保护与创新利用团队对中国主要绒山羊群体(西藏日土绒山羊、西藏班戈绒山羊、辽宁绒山羊、内蒙绒山羊、南疆绒山羊以及柴达木绒山羊)进行了全外显子组的重测序,利用群体基因组学和比较基因组学的手段来探究西藏绒山羊的高海拔适应机制。该研究成果“Exome sequencing reveals genetic differentiation due to high-altitude adaptation in the Tibetan cashmere goat (Capra hircus)”于近期在线发表于《BMC genomics》。
研究发现西藏绒山羊与其他绒山羊群体的遗传背景相差较大;通过高、低海拔地区的绒山羊的比较分析,发现受选择作用的基因(低氧诱导因子EPAS1、桥粒核心糖蛋白DSG3以及DSG2等)在心血管系统相关的信号通路中显著富集,表明心血管系统相关的信号通路与西藏绒山羊的高海拔适应性密切相关,这与前期研究发现的高海拔地区山羊具有较重的心脏、较低的心率等适应性表型相符合。
西藏绒山羊是一种世代生活在青藏高原,古老而优良的山羊品种,经过长期的自然选择和人工选择,对青藏高原特殊的环境表现出很强的适应性。但是目前对西藏绒山羊的高海拔适应性的遗传机制还研究甚少。本研究从外显子组水平对西藏绒山羊的高海拔环境适应的遗传基础进行了初步研究,揭示了西藏绒山羊高海拔适应性的潜在机制,对西藏绒山羊品种资源的保护和利用具有一定的理论指导意义。该研究工作得到国家自然科学基金(31272403)、中国农业科技创新平台以及中国农业科学院青年英才计划等项目的资助。
文章链接:http://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12864-016-2449-0