牧医所积极促进科研成果转化，为畜牧企业提供技术服务和支持。先后与多家企业开展了Z型北京鸭、黄羽肉鸡、“中苜”系列苜蓿以及优质乳工程等方面的科技合作，促进成果转化与产业发展。在国家农业科技创新联盟框架下，牧医所相继成立了畜牧、奶业、鸽业三个国家科技创新联盟，聚合全国畜牧业科研机构、院校、企业等单位及专家开展科技协同创新，为科技成果转化搭建桥梁，推动现代畜牧业健康稳步发展。

截至2024年3月，研究所在职职工232人，其中，中国工程院院士2人，正高级专业技术职称人员75人，副高级专业技术人员74人，博士生导师77人，国家级人才项目入选者34人；另有研究生、博士后、访问学者、科辅人员等900余人。设有动物遗传资源与育种、动物生物技术与繁殖、动物营养与饲料、草业科学、动物医学和畜产品质量与安全6大学科，有生物学、畜牧学、兽医学、草学四个博士授权点。在全国第四轮学科评估中，牧医所牵头组织参评的畜牧学评估结果为A+，在第五轮学科评估中继续保持优势。

建所以来，牧医所先后承担各类项目课题近千项，累计取得获奖成果150余项，包括国家技术发明和科技进步二等奖的成果24项，省部级奖励133余项。获审定品种40个，登记著作权软件190余个，国家专利授权460余项，其中发明专利260项，发表学术论文4300余篇，出版著作310余部。（数据更新时间：2021年11月）

牧医所现拥有6个科技创新平台、6个科技支撑平台、3个科技服务平台和1个大型仪器设备共享平台。动物营养学国家重点实验室是全国畜牧领域唯一一家国家级重点实验室。国家家养动物种质资源库是科技部认定首批国家基础科技平台之一。中心实验室拥有大型仪器设备160多台（套），建有基因组学、蛋白质组学等6大实验检测体系，向全社会实现了开放的科研资源共享，为行业科研提供服务。牧医所还拥有各类科研试验基地10个，其中，自有试验基地4个，共建科研基地6个。

牧医所积极开展国际学术交流与合作，选派访问学者进行国际交流与合作，接待来自世界30多个国家、地区和国际组织的专家学者开展学术交流，先后与美国、俄罗斯、澳大利亚、新西兰、欧盟、联合国粮农组织、国际原子能组织和国际家畜研究所等建立了良好的合作关系。“十一五”以来，共承担国际合作项目120多项。