个人信息
侯娅丽
姓名：侯娅丽
职称：研究员
专业：动物遗传育种
联系电话：13911224616
E-mail：houyali@caas.cn
一、个人信息
侯娅丽，山西晋城人，博士，研究员，农科院“青年英才”所级入选者，2005年获山西农业大学硕士学位，2009年获中国农业大学博士学位。2006-2008年，在丹麦奥胡斯大学遗传与生物技术系担任访问学者。2009-2012年，在美国农业部农业研究所动物与自然资源系做博士后研究。2012-2024年，在中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）工作。2024年5月至今，在中国农业科学院北京畜牧兽医研究所工作。
二、研究方向和成果
主要从事动物复杂表型形成的分子和细胞调控机制的基础研究。综合多组学、进化和计算生物学等多学科交叉，发展新方法，从遗传变异、时空调控和表型三个维度解析畜禽重要经济与抗病性状的组学基础、细胞机制及调控规律。以第一或通讯作者（含并列）在Nature Genetics、Nature Communications、Molecular Biology and Evolution、Genome Research、Nucleic Acids Research、Genomics Proteomics Bioinformatics等杂志发表论文30余篇；文章引用次数 > 2100 次。先后主持和参与国家级项目10余项。担任Genomics, Proteomics & Bioinformatics和AROH青年编委。
三、在研项目
1. 国家重点研发计划项目，整合多组学信息解析畜禽重要经济性状及精准选育，2025-2027，项目负责人。
2. 人才启动项目，2025-2027，项目负责人。
1、 代表性论文
1. Jiang Z#, Yan Z#, Hou Y#*, et al, The RodentGPOmics Atlas: a comprehensive database of rodent biology for genomes and pathogens, Nucleic Acids Research, 2024, gkae1074. (并列通讯，IF = 16.6 / Q1).
2. Pan C#, Hou Y#*, et al, Integrated analysis reveals that miR-548ab promotes the development of obesity and T2DM, Journal of Genetics and Genomics, 2024, https://doi.org/10.1016/j.jgg.2024.11.011. (并列一作，IF = 6.6 / Q1).
3. Hou Y as a member of The FarmGTEx Consortium. A compendium of genetic regulatory effects across pig tissues, 2023, Nature genetics, 56:1-12. (共同作者；IF= 41.307)
4. Guan D#, Bai Z#, Zhu H#, Zhong C#, Hou Y#*, et al, The ChickenGTEx atlas: the genetic regulation of multi-tissue and single-cell transcriptome signatures in chickens, Nature genetics, accepted. (并列一作；IF= 41.307)
5. Hou Y#, Zhao S#, Liu Q#, et al, Ongoing positive selection drives the evolution of SARS-CoV-2 genomes, Genomics, Proteomics & Bioinformatics, 2022, 20:1214-1223. (一作，IF = 9.5)
6. Li C#, Olave M#, Hou Y#, et al, Genome sequences reveal global dispersal routes and suggest convergent genetic adaptations in seahorse evolution, Nature Communication, 2021, 12: 1094. (并列一作，IF = 17.694)
7. Li C#, Hou Y#, Xu J#, et al, A direct test of selection in cell populations using the diversity in gene expression within tumors, Molecular Biology and Evolution, 2017, 34: 1730-1742. (并列一作，IF = 16.240)
8. Bickhart DM#, Hou Y#, et al, Copy number variation of individual cattle genomes using next-generation sequencing, Genome Research, 2012, 22: 778-790. (并列一作，IF= 14.397)
9. Fang L#, Hou Y#, An J, et al, Genome-wide transcriptional and post-transcriptional regulation of innate immune and defense responses of bovine mammary gland to Staphylococcus aureus, Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, 2016, 6: 193. (并列一作，IF= 6.073)
10. Zhao S#, Hou Y#, Zhang X#, et al, Pinpointing the animal origins of SARS-CoV-2: a genomic approach, Journal of Genetics and Genomics, 2022, S1673-8527(22)00153-9.（并列一作，IF = 5.723）
11. Xu L#, Hou Y#, Bickhart DM, et al, Population-genetic properties of differentiated copy number variations in cattle, Scientific reports, 2016, 6: 23161. (并列一作，5年IF= 5.5246)
12. Chen X#, et al, Hou Y#, Chu Q*, Population genomic sequencing delineates global landscape of copy number variations that drive domestication and breed formation in Chicken, Frontiers in Genetics, 2022, 13: 830393. (共同通讯作者，IF = 4.772)
13. Hou Y#*, Qi F#, Bai X#, et al, Genome-wide analysis reveals molecular convergence underlying domestication in 7 bird and mammals, BMC Genomics, 2020, 21: 204. (通讯作者，一作，IF = 4.547)