侯娅丽，山西晋城人，博士，研究员，博士生导师。1998年获山西农业大学学士学位；2005年获山西农业大学硕士学位；2009年获中国农业大学博士学位。2006-2008年，在丹麦奥胡斯大学遗传与生物技术系担任访问学者。2009-2012年，在美国马里兰大学、美国农业部农业研究所动物与自然资源系做博士后研究。2012-2024年，在中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）工作。2024年5月至今，在中国农业科学院北京畜牧兽医研究所工作。中国畜牧兽医学会动物遗传育种学分会第十一届理事会理事，中国畜牧兽医学会家禽学分会第十二届理事会理事，Genomics, Proteomics &Bioinformatics青年编委，Animal Research & One Health青年编委。中国农业科学院“农科英才创新型领军人才”，“青年英才”所级入选者。

    研究方向和成果

长期聚焦畜禽复杂性状解析与智能育种核心科学问题，系统整合多组学与多模态数据，揭示畜禽复杂性状形成的分子与细胞调控机制，构建生物育种知识图谱与智能育种大模型。以第一或通讯作者（含并列）在Nature Genetics（2篇）、Nature Communications、Nucleic Acids Research（2篇）、Molecular Biology and Evolution、Genome Research、Genomics Proteomics Bioinformatics等杂志发表论文30余篇，累计影响因子220。先后主持国家重点研发计划、国家重大研究计划等项目12项。

    在研项目

1. 国家重点研发计划项目“整合多组学信息解析畜禽重要经济性状及精准选育”，项目负责人。

2.创新工程项目“畜禽多模态知识图谱构建与智能化决策模型研发”，项目主持。

3.创新工程项目“畜禽复杂表型形成的分子和细胞调控机制”，项目主持。

4.新疆人才发展基金重点产业项目“新疆特色肉鸡品种培育与数智化育繁体系中试及产业化”，子课题主持。

5.基本科研业务“人工智能结合研究所科技发展相关研究-畜禽种质资源与动物疫病溯源数据中心”，项目主持。

6.畜禽生物育种全国重点实验室自主课题“畜禽肉质风味多组学融合建模与生成式智能解析大模型构建及其精准调控应用”，项目主持。

    代表性论文

 1. He J, Jia R, Du A, Zheng W, Han B, Zhang Q, Guo Z, Liu Y, Hou Y^*, Sun D^*. Pan-tissue transcriptomic profiling of dairy cattle, Journal of Animal Science and Biotechnology, 2026, 17: 120. (并列通讯; IF= 7.9 / Q1)

2. Hou Y^#*, Zou D^#, Chu Q^#, Zhan B^#, Wang R^#, Guan D^#, et al. The ChickenGTEx portal: a pan-tissue catalogue of regulatory variants shaping transcriptomic and phenotypic diversity, Nucleic Acids Research, 2026, 54(D1): D982-D993. (并列一作/并列通讯; IF= 15 / Q2)

3.Guan D^#, Bai Z^#, Zhu X^#, Zhong C^#, Hou Y^#, et al. Genetic regulation of gene expression across multiple tissues in chickens, Nature Genetics, 2025, 57(5): 1298-1308. (并列一作; IF= 25.5 / Q1)

4. Han B^#, Li H^#, Zheng W^#, Zhang Q^#, Hou Y^*, Liu G^*, Jiang Y^*, Sun H^*, Fang L^*, Sun D^*. A multi-tissue single-cell expression atlas in cattle, Nature Genetics, 2025, 57: 2546–2561. (并列通讯; IF= 25.5 / Q1)

5. Pan C^#, Hou Y^#, et al. Integrated analysis reveals that miR-548ab promotes the development of obesity and T2DM, Journal of Genetics and Genomics, 2025, 52: 231-244. (并列一作; IF = 7.1 / Q1).

6. Jiang Z^#, Yan Z^#, Hou Y^#*, et al. The RodentGPOmics Atlas: a comprehensive database of rodent biology for genomes and pathogens, Nucleic Acids Research, 2024, gkae1074. (并列一作/并列通讯; IF = 16.6 / Q1).

7. Hou Y^#, Zhao S^#, Liu Q^#, et al. Ongoing positive selection drives the evolution of SARS-CoV-2 genomes, Genomics, Proteomics & Bioinformatics, 2022, 20:1214-1223. (并列一作; IF = 9.5 / Q1)

8. Li C^#, Olave M^#, Hou Y^#, et al. Genome sequences reveal global dispersal routes and suggest convergent genetic adaptations in seahorse evolution, Nature Communication, 2021, 12: 1094. (并列一作; IF = 17.694 / Q1)

9. Hou Y^#, Xie Y^#, Yang S^#, Han B, Shi L, Bai X, et al. EEF1D facilitates milk lipid synthesis by regulation of PI3K-Akt signaling in mammals. The FASEB Journal, 2021, 35(5): e21455. (并列一作; IF=4.3 / Q2)

10. Li C^#, Hou Y^#, Xu J^#, et al. A direct test of selection in cell populations using the diversity in gene expression within tumors, Molecular Biology and Evolution, 2017, 34: 1730-1742. (并列一作; IF = 16.240 / Q1)

    联系方式

    联系电话：13911224616E-mail：houyali@caas.cn

     (更新时间:2026.9.20)