近日,中国农业科学院北京畜牧兽医研究所肉羊遗传育种科技创新团队利用RNA-seq测序技术整合分析了高、低产云上黑山羊卵巢组织中差异表达microRNA,构建了miRNA-mRNA互作调控网络,并对候选miRNA进行了功能验证,为山羊遗传改良提供了重要参考依据。相关研究结果发表在《生物医学中心基因组学(BMC Genomics)》上。
产羔数是山羊繁殖力的一个重要指标,主要由排卵率决定。然而,山羊高繁殖力性状在卵泡期的mircroRNA调控机制仍不清楚。研究人员以产羔数具有显著差异的云上黑山羊为对象,基于高通量测序技术,分别从差异表达mRNA和miRNA、miRNA-mRNA调控网络、GO和KEGG功能富集分析等方面筛选出了调控山羊多羔性状相关重要候选基因及其调控元件。随后,研究人员利用荧光定量PCR、双荧光素酶活性检测和CCK-8等技术,揭示了miR-1271通过调控靶基因 TXLNA 表达影响山羊产羔数的分子机制。
图 差异表达mRNA和miRNA火山图及RT-qPCR验证
该研究得到中国农业科学院科技创新工程、国家现代农业产业技术体系资助、云南省科技创新人才计划等的支持。博士后刘玉芳为文章第一作者,储明星研究员和洪琼花研究员为共同通讯作者。
原文链接:https://doi.org/10.1186/s12864-021-08156-2