近日，我所畜禽资源收集、保护与创新利用团队利用马高密度基因芯片(GeneSeek Equine SNP 65K)对中国体高差异较大的三个品种（德保矮马、蒙古马、伊犁马）进行选择信号研究，发现了影响德保矮马矮小特性相关关键基因HMGA2和TBX3基因。TBX3基因在德保矮马基因组中受过强烈的选择压力，而国外矮马品种未受选择。揭示德保矮马矮小特性存在不同于国外矮马的独立矮化机制。该成果已于2015年12月3日在线发表于国际学术期刊《基因组生物学和进化（Genome biology and evolution ）》。

动物体尺大小是进化过程中物种间及物种内差异较大的数量性状之一。了解体尺大小相关的遗传基础对研究人类疾病相关的遗传机制以及家养动物人工选择和提高生产性能很重要。目前高密度SNP芯片或大规模重测序技术已成功地应用于鉴定家畜全基因组选择性信号研究并取得可喜的成果。

该团队长期致力于动物遗传资源评价和特色基因资源挖掘研究，并探索遗传资源的可持续利用。世界除原产于英国的设特兰(Shetland)矮马以外，在我国西南地区也有矮马分布，德保矮马是其中的一个代表性品种之一，具有很高利用价值的基因资源。该研究为德保矮马起源及矮小性的遗传基础提供了分子理论依据，同时也为标记辅助选择在德保矮马育中的应用奠定了基础。

该研究由中国农业科技创新工程和家养动物种质资源共享平台资助。