近日,我所杜立新教授研究团队通过600K SNP芯片对3种典型尾型的中国绵羊品种构建了全基因组拷贝数变异(CNV)图谱。在国际上尚属于首例,相关研究成果于2016年6月10日正式发表于国际学术期刊nature旗下子刊《科学报告(Scientific Reports)》上。
中国地方绵羊品种按照尾型可分为脂尾型、脂臀尾和瘦尾型,绵羊尾型是由环境和基因共同决定的复杂性状。我国绵羊品种资源丰富,如何能找到决定绵羊尾部脂肪沉积的基因是育种学家们面临的一项重大课题。该研究结果表明,基因组CNV在决定绵羊尾型差异中发挥了重要作用。
该研究室长期致力于绵羊基因组学和转录组学的研究,此次利用高密度SNP芯片技术及大数据分析方法对3个不同尾型绵羊品种进行研究,共鉴定到493个不同的CNV区域,通过生物信息学分析发现PPARA, RXRA, KLF11, ADD1, FASN, PPP1CA, PDGFA和 PEX6基因影响绵羊尾型性状。该研究成果对今后的绵羊分子育种有推动作用。
文章链接:www.nature.com/articles/srep27822