我所猪遗传育种科技创新团队发现猪全基因组RNA编辑特征

作者：张龙超来源：猪遗传育种科技创新团队发布时间：2019-04-02

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　　近日，我所猪遗传育种科技创新团队发现猪多组织全基因组RNA编辑位点特征，为猪RNA编辑机制的分子调控研究提供了研究基础，为进一步研究猪表型变异的新型分子机制提供了重要参考。

　　RNA编辑是一种重要的转录后调控机制，可改变氨基酸序列、影响可变剪接、导致内含子滞留、影响RNA稳定性等，为解释诸多复杂的生命过程提供了一种方向。我所猪遗传育种科技创新团队利用RES-Scanner基于链特异性转录组测序和基因组重测序数据检测3头猪大脑、心脏、背部脂肪、肝脏、肺、背最长肌和卵巢中的RNA编辑位点，共检测到74863个非冗余RNA编辑位点，其中92.1%为A-to-G编辑，主要分布于非编码区，在CDS区中共检测到151个A-to-G编辑位点，其中94个可导致氨基酸改变，97.3%的A-to-G位点位于重复序列中，其中88.6%位于PRE-1中。关联分析发现，RNA编辑酶基因ADAR1和ADAR2的表达量与RNA编辑位点的数量及总编辑水平存在显著正相关（p<0.05）。脑组织中编辑位点最多，肌肉组织中最少。对组织特异性RNA编辑位点所在基因进行GO和KEGG通路富集分析发现，这些基因能够显著富集到与各自组织生物学功能相关的特异性生物学过程和通路。此结果说明，RNA编辑事件在组织形成与发育的过程中起了重要作用。

　　相关成果已发表在奶制品与动物科学top5%期刊《Journal of Animal Science and Biotechnology》。我所博士生张跃博为第一作者，张龙超副研究员和王立贤研究员为通讯作者。

　　原文链接：https://jasbsci.biomedcentral.com/articles/10.1186/s40104-019-0326-9