农产品质量与食物安全是适应农产品国际贸易不断增长、消费者质量安全意识不断增加的趋势和农产品质量安全科学管理、依法监督需求而发展起来的一门新兴学科。学科与作物栽培学、动/植物营养学、动/植物病理学、药理学、农药学、微生物学、预防兽医学、食品科学、农产品贮藏与加工、有机化学、分析化学、生物化学、农业经济管理、农产品国际贸易等学科密切相关。本学科主要研究农产品生产、加工与储藏过程质量安全控制、标准与检测、农产品溯源与真实性识别、风险评估与防控、质量安全管理、农产品功能成分等方面的理论和技术问题，为农产品质量与食物安全的研究和管理培养高级专门人才。
主要研究方向：
（一）农产品生产过程安全控制(Agro-product quality and safety control ) 以农产品生产全过程为研究对象，以保障农产品产地安全、阐明有毒有害物质的残留及消减规律以及建立高效安全种养殖过程控制体系为目标，以分析化学、环境化学、毒理学、植物学、动物学等为基础，通过化学、生物、农学等手段，研究农产品生产全过程的关键性问题，如开展重金属、违法添加物、持久性有机污染物环境过程研究；针对农药、兽药、生物毒素和违法添加物等，开展其在农产品中积累分布、代谢规律及危害机理研究、消减规律研究；开展安全替代投入品的评价利用与开发研究等，从源头控制农产品及食品风险，提高农产品生产过程的整体高效安全性。
（二）农产品贮藏与加工过程安全控制(Quality and safety control during Agro-product processing and storage) 以农产品贮藏、加工全过程为研究对象，以食品化学、毒理学、工程学、微生物学、分析化学等为基础，通过物理、化学、生物和工程技术等手段，研究农产品贮藏与加工过程中外源性和内生性有害物形成、迁移、累积、危害机理以及消减规律，建立农产品贮藏与加工过程质量安全控制的基础和应用基础理论，研发农产品贮藏与加工过程中质量安全控制的共性和关键技术，革新农产品加工工艺，改善和保障农产品及其制品的质量与安全水平。
（三）质量安全标准与检测(Standard and testing technology) 以农产品污染物、重要品质或特征组分为研究对象，以保障农产品质量与安全为目标，以食品化学、分析化学、环境化学、仪器分析、化学计量学、药物分析、生物学、生物化学为基础，通过污染物和特征组分检测技术等手段，研究影响农产品质量与安全的相关要素，为农产品质量与安全的检测和评价标准制定提供理论和方法依据；开展农产品污染物的快速筛查技术、未知物分析识别技术、高效样品前处理技术以及确证检测技术研究，研制新技术与新产品及技术标准及监测用标准物质，为农产品质量与安全的监测预警和过程控制提供重要技术支撑。
（四）农产品追溯和真实性识别(Traceability and authenticity identification) 以名特优新农产品为研究对象，以维护广大消费者安全和保障优质农产品诚信为目标，以分析化学、法医学、分子生物学以及化学计量学等多学科结合为基础，通过对优质特色农产品多种特征性表征因子分析与识别，建立优质特色农产品综合识别技术，研究并利用化学计量学方法，建立溯源识别、真实性鉴别模型及数据库，最终建立优质农产品标签标志识别、特征性表征因子化学分析识别、电子信息技术三者有机结合的优质农产品综合鉴别技术，为我国优质农产品市场监控提供技术支撑。
（五）风险评估与管理( Riskassessmentandmanagement ) 以食用农产品中的污染物为研究对象，以生物学、毒理学、食品检验学、营养学、统计学为基础，通过检验监测、暴露评估、危害效应评价、风险预警技术等手段，评价食用农产品中污染物的风险水平，为农产品质量安全科学管理和标准制定提供理论和科学依据。以农产品质量安全管理为研究对象，以信息不对称理论、公共管理理论、质量安全理论和农业经济理论为基础，通过社会调查访问和案例分析等手段，开展农产品质量安全和农业标准化发展战略、公共管理政策等经济学研究，以及农业标准化实施模式、效益评价研究，为保障农产品质量安全提供技术支撑和决策支持。
（六）农产品功能成分评价（Analysis on functional components of agro-products） 以植物资源为对象，以现代分离纯化工程、发酵工程、细胞工程、基因工程等高新技术为手段，开展植物资源高值化、功能成分的高效提取与利用技术、功能成分提取物主要生物活性等方面研究，开展农产品品质分级及判定综合技术体系研究，为农产品品质的科学评价提供依据。