个人信息
潘章源
个人信息
潘章源,男,1986年10月生,江西赣州人,研究员,博士生导师。2016年6月博士毕业于中国农业科学院,动物遗传育种与繁殖专业。2018年至2022年在美国加州大学戴维斯分校从事博士后研究。2022年9月至今在中国农业科学院北京畜牧兽医研究所工作,为国家重点研发青年科学家、中国农科院杰出青年英才(海外)、肉羊遗传育种创新团队骨干专家。主要从事家养动物基因组表观调控研究。2023年入选国家海外高层次青年人才。
研究方向与主要成果
主要从事畜禽表观调控元件功能注释研究,并应用于功能靶点挖掘和解析。综合利用基因组学、表观调控组学、分子生物学等多学科交叉手段,针对基因区、调控区和跨物种保守区的功能靶点挖掘提出了不同的研究策略,①构建完善了多个畜禽物种调控元件图谱,打破了强遗传连锁,显著提高了非编码区调控靶点挖掘效率;②通过跨物种比较,促进了保守性功能靶点的跨物种应用;③挖掘和鉴定了一批与角、尾脂、日增重、抗病力等性状有关的功能靶点。以第一作者或共一在Nature Communications、Science Advances、Genome Biology、GigaScience、BMC Genomics等杂志发表论文,获国家发明专利5项;为国际家养动物GTEx项目主要负责人、国际家养动物功能基因组注释(FAANG)项目主要执行人。担任Genes编委和Epigenetics、BMC Genomics、Animal Biotechnology等期刊审稿人。主持国家自然科学基金和国家重点研发青年科学家等项目。
在研项目
1.国家海外高层次青年人才项目,畜禽调控组学,2023-2026,200万,主持。
2.十四五国家重点研发计划青年科学家项目:基于多维组学精准解析绵羊多羔性状遗传机制和设计育种技术研发,2023-2028,200万元,主持。
3.国家自然科学基金-青年基金:RXFP2基因E641K错义突变影响绵羊角生长发育的作用机制,2019.01-2021.12,26万元,主持。
4.国家重点研发计划课题:主要农业动物优异种质资源形成与演化机制—主要农业动物优异性状相关基因、位点的挖掘和功能研究,2023.01-2027.12,70万元,子任务负责人。
5.中国农业科学院青年英才(海外)引进人才启动经费,2023.01-2023.12. 80万元,主持。
代表论文和专利
1.代表论文
1)Zhangyuan Pan#, Ying Wang#, Mingshan Wan#, Yuzhe Wang#, Xiaoning Zhu, Shenwen Gu, Conghao Zhong, Liqi An, Mingzhu Shan, Joana Damas, Michelle M. Halstead, Dailu Guan, Nares Trakooljul, Klaus Wimmers, Ye Bi, Shang Wu, Mary E. Delany, Xuechen Bai, Hans.H. Cheng, Congjiao Sun, Ning Yang, Xiaoxiang Hu, Harris A Lewin, Lingzhao Fang*, Huaijun Zhou*. An atlas of regulatory elements in chicken: a resource for chicken genetics and genomics. Science Advances, 2023, 9(18):ade1204.
2)Zhangyuan Pan#,Yuelin Yao#, Hongwei Yin, Zexi Cai, Ying Wang, Lijing Bai, Colin Kern, Michelle Halstead, Kelly Chanthavixay, Nares Trakooljul, Klaus Wimmers, Goutam Sahana, GuoshengSu, MogensSandø Lund, Merete Fredholm, Peter Karlskov-Mortensen, Catherine W. Ernst, Pablo Ross, Christopher K. Tuggle, Lingzhao Fang*, Huaijun Zhou*. Pig genome functional annotation enhances the biological interpretation of complex traits and human disease.Nature Communications, 2021, 12(1):5848.
3)Zhangyuan Pan#, Shengdi Li#, Qiuyue Liu#, Zhen Wang, Zhengkui Zhou, Ran Di, Benpeng Miao, Wenping Hu, Xiangyu Wang, Xiaoxiang Hu, Ze Xu, Dongkai Wei, Xiaoyun He, Liyun Yuan, Xiaofei Guo, Benmeng Liang, Ruichao Wang, Xiaoyu Li, Xiaohan Cao, Xinlong Dong, Qing Xia, Hongcai Shi, Geng Hao, Jean Yang, CuichengLuosang, Yiqiang Zhao, Mei Jin, Yingjie Zhang, ShenjinLv, Fukuan Li, Guohui Ding, Mingxing Chu*, Yixue Li*. Whole-genome sequences of 89 Chinese sheep suggest role of RXFP2 in the development of unique horn phenotype as response to semi-feralization, GigaScience, 2018, 7(4):giy019.
4)Yuelin Yao#, Shuli Liu#, Charley Xia#, Yahui Gao#, Zhangyuan Pan#(共一), Oriol Canela-Xandri, Ava Khamseh, Konrad Rawlik, Sheng Wang, Bingjie Li, Yi Zhang, ErolaPairo-Castineira, Kenton D'Mellow, Xiujin Li, Ze Yan, Cong-jun Li, Ying Yu, Shengli Zhang, Li Ma, John B. Cole, Pablo J. Ross, Huaijun Zhou, Chris Haley, George E. Liu*, Lingzhao Fang*, Albert Tenesa*. Comparative transcriptome in large-scale human and cattle populations. Genome Biology,2022, 23:176.
5)Colin Kern, Ying Wang, Xiaoqin Xu, Zhangyuan Pan, Michelle Halstead, GanreaChanthavixay, Perot Saelao, Susan Waters, Ruidong Xiang, Amanda Chamberlain, Ian Korf, Mary E. Delany, Hans H. Cheng, Juan F. Medrano, Alison L. Van Eenennaam, Chris K. Tuggle, Catherine Ernst, Paul Flicek, Gerald Quon, Pablo Ross*, Huaijun Zhou*. Functional annotations of three domestic animal genomes provide vital resources for comparative and agricultural research.Nature Communications, 2021, 12(1): 1821.
6)Zhangyuan Pan,Xiangyu Wang, Ran Di, Qiuyue Liu, Wenping Hu, Xiaohan Cao, Xiaofei Guo, Xiaoyun He, ShengjinLv, Fukuan Li, Hui Wang, Mingxing Chu. A 5-methylcytosine site of growth differentiation factor 9 (GDF9) gene affects its tissue-specific expression in sheep. Animals,2018, 8(11): 200.
7)Zhangyuan Pan, Shengdi Li, Qiuyue Liu, Zhen Wang, Zhengkui Zhou, Ran Di, Xuejiao An, Benpeng Miao, Xiangyu Wang, Wenping Hu, Xiaofei Guo, ShenjinLv, Fukuan Li, Guohui Ding, Mingxing Chu, Yixue Li. Rapid evolution of a retro-transposable hotspot of ovine genome underlies the alteration of BMP2 expression and development of fat tails. BMC Genomics,2019, 20(1):261.
8)潘章源,张自杰, 季久秀, 李华振, 孙安芳, 李富宽, 王慧, 储明星*, 吕慎金*. 绵羊INSL3基因组织表达规律与潜在功能位点分析研究. 畜牧兽医学报, 2020, 51(4):679-687.
9)潘章源, 贺小云, 郭晓飞, 刘秋月, 胡文萍, 狄冉, 王翔宇*, 储明星*. 全基因组测序在畜禽群体进化和功能基因挖掘中的应用. 农业生物技术学报, 2016, 24(12):1945-1954.
10)潘章源, 贺小云, 王翔宇, 郭晓飞, 曹晓涵, 胡文萍, 狄冉, 刘秋月*, 储明星*. 家养动物选择信号研究进展. 遗传, 2016, 38(12):1069-1080.
2.专利
潘章源,李富宽,吕慎金,魏明吉,王振南,孙培明. 一种获取完整羊脑的开颅方法. ZL201710083059.5。授权日期:2020年5月1日。
潘章源,吕慎金,李富宽, 储明星,王慧.一种与绵羊尾型相关的SNP分子标记及其应用. ZL201711303789. 8。授权日期:2020年12月1日。
潘章源,吕慎金,李富宽, 储明星,王慧. 一种与绵羊尾宽相关的SNP分子标记及其应用. ZL201711303786. 4。授权日期:2020年12月1日。
潘章源,吕慎金,李富宽, 储明星,王慧. 一种与绵羊尾长相关的SNP分子标记及其应用. ZL201711303812. 3。授权日期:2021年1月29日。
储明星,潘章源,刘秋月,狄冉,胡文萍,王翔宇,曹晓涵. 与绵羊角表型相关的RXFP2基因SNP标记组合及其应用.ZL201511023518.8。授权日期:2018年7月3日。
联系方式
联系电话:13671099320 E-mail:zhypan01@163.com
(简历更新时间2024-1-17)